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博客

本博客收录了来自PacBio--以及我们的合作伙伴和同事--的声音,讨论关于HiFi测序的最新研究、出版物和更新。

2022年07月01日  |  产品、程序+实验方案

HiFi 的不同之处:开启参考泛基因组时代

magenta pink logo for HiFi

PacBio HiFi 测序已在众多研究项目中用于生成参考级别质量的基因组,其中最知名的一项莫过于最终完成的人类基因组的完整测序。 继该项目之后,人类泛基因组参考联盟 (HPRC) 目前正在生成 300 多个参考级基因组,旨在充分捕捉人类群体的遗传多样性。


2022年05月03日  |  动植物生物学

农业基因组学用于病虫害研究

agrigenomics - PacBio

在处理生命周期短且繁殖速度快的昆虫、真菌和微生物时,经常会遇到在单一种群中存在高度可变的遗传学问题。 幸运的是,HiFi 测序已成为一种方便的工具,可帮助研究人员找到昆虫、真菌和微生物中负责免疫、代谢解毒和抗杀虫剂的新型基因。


2022年02月15日  |  动植物生物学

实践进展第三部分: 动物基因组学

自 1998 年以来,从第一个发表的动物基因组序列——9700 万碱基对 (bp) (Mb) 秀丽隐杆线虫——到目前 GenBank 中跨越 24 个门的近 3,300 种独特动物物种,我们对基因组如何变化和塑造地球生物多样性的了解有了极大的提升。


2022年01月20日  |  动植物生物学

实践进展第一部分: 昆虫基因组学

butterfly

正如 Washington State University(华盛顿州立大学)博士后 Scott Hotaling 在他对 20 年的昆虫研究综述中提到的那样,“我们已经进入了昆虫基因组生物学的新时代。” “最值得注意的是长读长测序的影响;包含长读长的组装比不包含长读长的组装的连续性高出约 48 倍。Sequel II 系统上添加的低和超低 DNA 起始量工作流程通过助力对最小物种的测序,进一步使昆虫学家受益。


2021年03月04日  |  生物多样性

转录组技术:更近距离的观察巨型红杉基因组

Redwood tree grove with sun shining through trees

通过将定相的基因组信息与定相的转录组数据相结合,Tseng 得以鉴定出 5 个截然不同的等位基因,以及很可能同源的基因 “Iso-Seq 对 PacBio 基因组的高可比对性表明,基因组组装在编码区域非常完整,”她说。


2020年04月15日  |  动植物生物学

要么做“大”,要么待在家——处理巨型基因组

Redwood tree grove with sun shining through trees

为了给 Sequel II 系统寻找测序挑战,我们选择了加利福尼亚红杉,也就是科学家所说的 Sequoia sempervirens。 我们希望,随着 PacBio HiFi reads 使用的不断增加,我们将继续看到全部基因组组装的改进,包括巨大以及更加复杂的多倍体植物。


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