农业基因组学

农业基因组学解决方案

无论您的研究重点是作物或牲畜育种、基因工程还是病虫害防治，HiFi 测序都能提供十分出色、详细的基因组数据，以满足您雄心勃勃的研究计划的需求。

基因组育种

使用 HiFi 测序，通过快速组装定相参考级别质量的基因组来推断最理想的复杂性状，从而更好地进行育种。

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动植物基因工程

使用 HiFi reads，快速可靠地创建高质量的参考基因组、验证构造子、确认编辑并评估脱靶效应。

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病虫害研究

深入研究超高质量和特异性的基因组和转录组。揭示调控免疫、代谢解毒和杀虫剂耐药性等特性的难以发现的新基因。

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roundel image of a crowd of people walking in a city

应对全球挑战，满足日益增长的人口需求

随着全球人口不断增长和气候变化的不断加剧，需要前沿的农业生物技术来推动科学进步，以可持续的方式养育全球人口。
PacBio 提供先进的基因组测序解决方案，为您生成超高质量的详细数据，您可以从中发现新的农业基因组见解，并充分利用这些新见解。
这些生物学见解可以帮助您加强标志物的开发，有利于生产更有营养的食品，保护作物和牲畜健康，并提高农业产量，助力当下，共创未来。

关于农业基因组学的常见问题

A pangenome is a collection of genomes from a population of species that represents the genetic diversity of the population. Pangenomes typically are 20-30 genomes depending on the biodiversity of the population. Pangenomes obtained through HiFi sequencing can be resolved into haplotype databases for enhanced trait imputation for desirable phenotypes for breeding.

Whole genome sequencing, transcriptome sequencing, epigenomics, metagenomics, and the targeted sequencing of plants, animals, fungi, bacteria, and complex populations can all be leveraged for your agricultural research in different areas. This includes breeding, pest management, and genome engineering.

Genome engineering, or gene editing, is a process where scientists can change the genetic information of agriculturally important species with biomolecular tools such as CRISPR-Cas9. HiFi sequencing can help you validate where edits are made on a genome-wide or targeted basis. It can also help you design more efficient workflows with extremely accurate genomic information.

HiFi sequencing enables agriscientists to generate haplotype-resolved, high-quality genomes that span most variant types. Complex traits, such as drought resistance and pest resistance, can be explained by a combination of genes, structural variants, copy number variants, and more. Agriscientists can harness this genetic information to inform marker development.

农业基因组学实际应用

农业基因组学手册

让您的团队快速了解 HiFi 测序在农业基因组学应用中的优势。

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大豆泛基因组捕获遗传多样性

了解如何使用 HiFi reads 来识别关键的结构变异，以进行功能研究并培育世界上最重要的蛋白质来源之一。

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全基因组测序最佳实践

请参阅推荐的从头获取参考级别质量基因组的工作流程。

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HIFI 测序 — 更好地了解牛基因组

评估如何使用 HiFi 测序来组装具有数百种对表型至关重要的结构变异的牛泛基因组，同时获得出色的覆盖度、质量、准确性和完整性指标。

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探索

本站的综合信息文库中收录了关于动植物基因组相关的文献、报告、论文和视频，单击下方按钮立即探索更多内容。

探索资源

“……高质量的 [HiFi] 基因组能够识别多种复杂变异，而简单地将短读长定位到单个基因组是无法检测到这些变异的……”
— Yucheng Liu 等，2020《Cell》

Crop and livestock breeding roundel image showing a black and white cow

农业基因组学用于作物和牲畜育种

只有 HiFi 测序才能实现高质量的基因组长读长测序，为您的动植物育种计划解锁全新能力。

• 构建用于育种的单倍型分辨率参考级别质量的泛基因组。
• 利用 SNP、结构变异和复杂基因型实现理想性状。
• 在全基因组范围内捕获远交系、近交系和种群中的基因组变异。

农业基因组学用于基因组工程

使用高精准度 HiFi 测序数据获取复杂的基因编辑计划所需的详细序列信息。

• 使用准确的参考基因组加快设计工作流程。
• 在转录组中寻找剪切变异体。
• 验证编辑的位点。
• 捕获在靶和脱靶效应。
• 确定染色体间的结构重排。

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农业基因组学用于病虫害研究

寻找昆虫、杂草和真菌等危害农业产量的生物体的高度可变遗传学中隐藏的基因组线索，从而在分子水平上解决害虫问题。

• 更详细地了解害虫基因组多样性。
• 用起始量仅为 5 ng 的 DNA 进行完整的基因组组装。
• 构建注释以更好地理解用于靶向的基因功能。

农业基因组学博客系列

阅读我们最新的博客系列，详细了解生物多样性如何推进育种，基因组学如何保护作物和牲畜，以及提高准确性对基因编辑工作流程有何意义。

作物和牲畜育种病虫害研究基因组工程

Agrigenomics blog series image showing icon for breeding, pests and biology

PacBio vs Oxford Nanopore*

长读长测序性能	PacBio HiFi 测序	Oxford Nanopore
满足质量目标所需的覆盖度	19x 二倍体	56x 二倍体
所需的 CPU 时间 (h)	600	2200
所需的内存使用峰值	200GB	750GB

*Alexander S. Leonard, Danang Crysnanto, Zih-Hua Fang, Michael P Heaton, Brian L. Vander Ley, Carolina Herrera, Heinrich Bollwein, Derek M. Bickhart, Kristen L. Kuhn, Timothy PL. Smith, Benjamin D. Rosen, Hubert Pausch. Structural Variant-based Pangenome Construction has Low Sensitivity to Variability of Haplotype-resolved Bovine Assemblies. [Preprint] bioRxiv 2021.11.02.466900; doi: https://doi.org/10.1101/2021.11.02.466900