HiFi 的不同之处——节省深度,结果更优,同样实现千兆碱基测序
迄今为止,已有数百篇文章描述了用于微生物、真菌、植物、动物和人类基因组 De Novo 组装的 PacBio HiFi 测序,而科学界也通过多次基准比较验证了 PacBio HiFi 测序的一流性能。
本博客收录了来自PacBio--以及我们的合作伙伴和同事--的声音,讨论关于HiFi测序的最新研究、出版物和更新。
迄今为止,已有数百篇文章描述了用于微生物、真菌、植物、动物和人类基因组 De Novo 组装的 PacBio HiFi 测序,而科学界也通过多次基准比较验证了 PacBio HiFi 测序的一流性能。
PacBio HiFi 可直接对未经改动的 DNA 分子进行测序,不仅便于用户查看整个基因组(包括由于短读长测序仪本身的局限性而被视为难以用 NGS 测序的区域)的全貌,而且不会导致出现此类偏差,而使用合成的长读长结构则无法克服这一挑战。
PacBio 推出的 HiFi 测序可提供必要的、高度准确的长序列 reads 组合,让我们能够常规生成完全定相的二倍体基因组组装,反应了生物样本的真实基因组信息,揭示了生物体基因组学的全貌。
上周,端粒到端粒 (T2T) 联盟宣布,他们获得了人类基因组的第一个完整序列。时至今日,科学界依然对这项惊人的成就议论纷纷。PacBio HiFi 测序的表现十分突出,它使用来自 T2T 联盟最近测序并组装的 CHM13 样本中的数据完全解析了端粒的长度和序列内容。
PacBio 推出的 Iso-Seq 方法已在众多论文中得以应用,让研究人员对转录组的复杂性及其对理解生物学和疾病的影响有了一些新的见解。 与短读长 RNA-seq 仅可观察转录本的小片段不同,长读长、全长 RNA 测序能够直接观察整个剪切异构体。
PacBio HiFi 测序能够提供最准确、最连续、最完整的基因组和表观基因组信息,得到了越来越广泛的应用,助力基因组学履行改善人类健康的承诺。 这些示例再次印证了科学界多年来得出的结论——合成长读长测序根本无法与 PacBio HiFi 测序产生的真正长读长测序的优势相提并论。
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