RNA测序
长读长测序是 RNA 测序的未来！Iso-Seq 方法可对整个 cDNA 分子（长达 10 kb 或更长）进行测序，无需进行生物信息学转录本组装，因此您可以对批量和单细胞转录本组中的新基因和异构体进行表征，并进一步：
- 鉴定替代剪接 (AS) 事件，包括替代起始位点、终止位点、内含子保留和外显子跳转事件
- 发现肿瘤样本中的基因融合
- 识别等位基因特异性异构体
- 检测差异表达的同种型和同种型转换事件
- 通过开放阅读框 (ORF) 预测新型异构体的功能影响
人类转录组研究
探索异构体使用的改变如何导致健康和疾病间的表型差异。
动植物转录组研究
利用无需参考基因组的全长 cDNA 测序加速育种项目和基础研究。
“利用 Iso-Seq 可靠地检测到的超过 50% 的异构体无法用标准 RNA 测序方便地重现，强调了长读长测序鉴定异构体多样性的优势。”1
利用 ISO-SEQ 分析进行 RNA 测序实践
RNA 应用的正确解决方案
RNA 数据集
关于 PACBIO ISO-SEQ 方法和 RNA 测序的常见问题
Iso-Seq 方法指利用 PacBio SMRT 测序技术测序全长 cDNA。全长 cDNA 可由真核 RNA、细菌 RNA 甚至病毒 RNA 产生。由于全长 cDNA 在一个 HiFi reads 中测序，因此无需组装。
Iso-Seq 方法和生物信息学工作流程可产出 10 kb 及以上的高质量全长转录本序列。HiFi reads 的高准确度确保可鉴定 SNP，并且可将 UMI 和条码用于单细胞研究。
Kinnex试剂盒提供可扩展、高性价比的RNA测序解决方案。Kinnex全长RNA试剂盒（与Iso-Seq express 2.0试剂盒一起）为全转录组RNA测序提供了端到端的解决方案。Kinnex单细胞RNA试剂盒可用于对单细胞cDNA进行测序，例如来自10x Chromium单细胞试剂盒的那些。Kinnex 16S rRNA试剂盒提供全长16S rNA测序。
长读长RNA测序可以提供全长异构体信息，而传统的短读长技术依赖于计算转录物组装，无法明确解析异构体结构。Kinnex全长RNA试剂盒可以对使用Iso-Seq express 2.0试剂盒产生的全长cDNA进行测序，通过超高的通量和准确性表征和比较异构体。
长读长单细胞RNA测序可以在单细胞水平上提供异构体信息，而传统的短读长测序只能提供基因信息。Kinnex单细胞RNA试剂盒可以对全长单细胞cDNA进行测序，例如来自10x Chromium系统的cDNA，从而能够深入了解单细胞RNA生物学。
长读长技术可以识别癌症融合基因的全长转录结构，这些基因可能表达多种异构体。Iso-Seq方法已被用于鉴定癌症融合基因。实例包括鉴定B细胞急性淋巴细胞白血病中的IGH-DUX4融合物、SKBR3细胞系中的3跳融合物和被短读数据错误分类的卵巢癌症患者特异性融合物。
Iso-Seq方法已被证明具有与匹配的短读长数据一致的基因水平表达，同时能够识别使用短读数据无法观察到的差异转录物使用（DTU）。例子包括在发育中的大脑中识别DTU，冬眠棕熊的同种型转换事件，以及衰老综合征大脑中的细胞类型差异。
SMRT-Link等序列和单细胞等序列工作流程完全支持在PacBio系统上生成的长读长RNA序列数据。我们的https://isoseq.how/wiki页面进一步详细介绍了命令行的用法。最后，我们的全长同种型测序生物信息学工具应用简报中有一份用于三级分析的社区工具推荐列表。
