单细胞 RNA 测序
用于单细胞转录组研究的全长异构体信息
以单细胞分辨率揭示隐藏的异构体多样性
在异构体水平上了解细胞异质性对于基础研究和疾病研究都至关重要。短读长只能捕获基因级信息，而其他长读长技术精准识别 UMI/条形码的准确率不够。
在单细胞研究中，只有 HiFi reads 可以实现准确的异构体检测。不需要复杂的条形码校正算法或正交测序数据。使用 MAS-Seq 方法进行单细胞异构体测序，您可以：
- 获得比常规单细胞 Iso-Seq 文库高 16 倍的通量
- 超越基因计数，获得全长异构体信息
- 在单细胞水平上描述完整的转录本异构体多样性
- 揭示细胞类型特异性的剪切异构体和表达变异
长读长揭示了不同细胞类型的异构体差异。读长覆盖了带有单细胞标记信息的整个异构体。
Mas-Seq single-cell sequencing
限时促销，半价折扣—PacBio MAS-Seq 发现隐藏单细胞全长转录本多样化信息
HiFi单细胞全长转录本测序方案，中国区客户专属优惠半价促销
——即刻洞见单细胞水平RNA多样化全长转录本信息！
- 与常规单细胞测序方法相比，通量提高了 16 倍
- 支持 10x Chromium Next GEM Single Cell 3′ 试剂盒生成的 cDNA
- 目标样本为3,000-10,000个细胞文库
- 准确识别 Cell Barcode 和 UMI 序列，获得单细胞水平全场转录本信息
- 研究细胞类型特异可变剪切，无需其他测序数据补充验证
HIFI 测序对单细胞 RNA 测序的优势
关于单细胞 RNA 测序和 MAS-SEQ 试剂盒的常见问题
单细胞 RNA 测序 (scRNA-seq) 能够表征源自复杂组织的单个细胞之间的基因表达差异，提供更高分辨率的转录组信息。典型的单细胞文库输入 RNA，输出用单细胞条形码和唯一分子标签 (UMI) 标记的 cDNA 分子，这样转录本可以追溯到其“单细胞”起源。这与批量 RNA 序列相反，批量 RNA 序列没有单细胞条形码可以将转录本追溯回细胞。
使用 PacBio HiFi reads 的单细胞 RNA 测序提供了单细胞水平的全长异构体信息。短读长测序仅对转录物一端的短片段进行测序，仅提供基因水平信息。相比之下，PacBio HiFi reads 可以覆盖整个转录本，揭示单细胞水平的异构体多样性。异构体——而不是基因——通常是疾病和生物学的驱动因素。
MAS-Seq 方法是一种将单细胞平台生成的 cDNA 分子连接到更长的连接片段从而提高通量的连接方法，由 Al'Khafaji 等人开发。然后，通过串联分子测序产生的 HiFi reads 经过生物信息学分解，即可回收原始分子。结果可获得更高的通量并减少测序需求。作者表明，将 MAS-Seq 方法应用于 10x 单细胞文库，可以区分与癌症相关的细胞类型特异性异构体，这些异构体使用短读长单细胞 RNA-Seq 无法检出。
能！使用 MAS-Seq，您可以获得单细胞文库的全长异构体信息，而使用其他测序方法（如短读长），您只能获得基因水平的信息。使用 MAS-Seq（Al'Khafaji 等人）或常规 HiFi 测序的多篇出版物（Palmer 等人、Joglekar 等人）都证明了 PacBio 可用于鉴定细胞类型异构体的特异性。
不需要。利用 MAS Seq 试剂盒，在 PacBio 长读长系统上使用 1 个 SMRT CELL，PacBio HiFi 测序可为典型单细胞实验提供足够的覆盖范围。不需要正交测序技术。
MAS-Seq 试剂盒与使用 10x Chromium Next GEM Single Cell 3' 试剂盒 (v3.1) 生成的 cDNA 兼容。
聆听 MAS-SEQ 如何改变单细胞 RNA 测序的世界
应用简报
用于癌症研究的单细胞转录组
用于癌症研究的更完整的转录组——目前处于单细胞水平。使用 MAS-Seq 升级您的单细胞癌症研究，用于：
- 发现作为潜在生物标志物的异构体，并帮助实现治疗目标
- 识别融合异构体
- 检测表达突变
