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2022年11月09日  |  申请 SMRT Grants

2022年SMRT补助金获得者

2022 年 SMRT Grant 精准HiFi项目赞助获得者
PacBio 很荣幸向大家介绍今年 SMRT Grant精准HiFi计划的获得者。

在 PacBio,我们致力于创造精确的基因组测序技术,以便开拓基因组学的新领域。HiFi 测序技术能够使 15 kb reads 具有 Q30 准确度,生成地球上一些复杂基因组的完整、连续和正确的组装。

通过 SMRT Grant计划,PacBio 公司将免费的 HiFi 测序服务颁给有潜力在全系列测序应用领域中推动科技进步的优秀研究提案。

我们感谢亚利桑那基因组研究所、华盛顿基因组研究所和乌普萨拉基因组中心的慷慨支持。如果没有这些杰出的合作伙伴,今年的 SMRT Grant 精准HiFi 项目赞助将无法实现。

2022 年度最佳研究者
我们很荣幸地介绍 2022 年度 SMRT Grant精准 HiFi项目赞助的三位获得者,他们的研究前景令我们感到振奋。

今年的 SMRT Grant 精准HiFi项目赞助收到了数百份申请和一系列创新的想法。我们从世界各地挑选了三位杰出的获胜者,他们试图从癌症生物学的奥秘到蜘蛛的进化,从而揭示大自然的秘密。以下是 2022 年的获胜提案:

Shiro Fujita 医学博士
呼吸内科
日本神户中心医院

 

 

 

探索无吸烟史的非小细胞肺癌和甲状腺癌交叉病例的遗传易感性

 

研究表明,在非小细胞肺癌的女性患者中,从不吸烟的人比有吸烟史的人更有可能患有乳头状甲状腺癌,这意味着在这些癌症的发病过程中,除了烟草烟雾之外,还有其他诱发因素 (Fujita S, et al. Intern Med 2015) (Fujita S, et al. Sci Rep 2021)。Shiro Fujita 的团队申请了这项 SMRT Grant计划,旨在利用 PacBio 长读长测序技术,探索与非小细胞肺癌和乳头状甲状腺癌患者中 DNA 错配修复相关的基因种系结构变异。

 

Troy LoBue
美国奥本大学

研究非裔美国人乳腺癌的结构突变 (SV)

 

 

与其他种族相比,非裔美国人 (AA) 妇女在 40 岁之前罹患乳腺癌的比例更高,且三阴性乳腺癌的诊断不成比例。遗传性风险因素可能起作用,但 AA 遗传性乳腺癌还没有得到充分研究。使用 PacBio HiFi 测序,Troy LoBue 和他的团队将对来自阿拉巴马遗传癌症队列的 AA 个体进行 WGS 以及病例/对照关联测试,以确定增加 AA 遗传性乳腺癌风险的变异。HiFi 测序将用于提供更精确和有效的变异鉴定,提高与癌症相关的新遗传风险因素的发现潜力。

 

Yannis Schöneberg
德国特里尔大学

对活化石进行排序以了解蜘蛛的进化

 

 

七爪蜘蛛属是现存蜘蛛中最原始的一科,大约在 4 亿年前分化出来。这些“活化石”的独特之处在于,它们这一科唯一保留了其他蜘蛛已经失去的原始多形节腹部和所有四对吐丝器。七爪蜘蛛基因组将为研究人员就重要蜘蛛基因(包括蜘蛛丝蛋白和毒液基因)的进化和起源提供全新的见解。然而,由于其庞大的规模和复杂性,这一直是个挑战。Yannis Schöneberg 希望 HiFi 测序能让我们掌握这个特殊和重要的基因组。

这些杰出的研究提案完美展示了 HiFi 测序的长度和准确度对于回答生物学中一些挑战性和有趣问题有着无数种方式。如果有兴趣获得 HiFi 测序的解释能力,以便在研究项目中开辟新的研究途径,可以考虑申请一项 SMRT Grant计划

 

让我们再次祝贺所有的获得者!

关于 SMRT Grant计划

对免费测序感兴趣吗?学习如何申请获取的机会。

SMRT Grant计划为科研人员提供了为其研究项目获得免费 HiFi 测序服务的机会。

对生命科学的所有领域都提供资助。无论是在研究复杂的微生物群、复杂的植物多倍体、稀有和濒危物种,还是在研究人类基因组的盲区,您都可以得到一笔资助。

如果想申请,只需选择一个与您的研究领域相关的公开资助项目,阅读说明,填写申请表,并简洁地告诉我们您的研究将如何从 HiFi 测序中受益。对申请进行评估,确定获得者后,我们的专家会联系他们,与经批准的测序服务供应商协调,发放免费的耗材、文库制备、HiFi 测序和初始生物信息学分析。

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