在 PacBio，我们致力于创造先进的多组学测序技术，以便您在癌症研究方面开辟新的前沿。
通过SMRT Grant计划，PacBio HiFi 测序服务向杰出的研究方案提供免费的 HiFi 测序服务，这些研究方案有可能在癌症生物学、微生物科学、动植物生物学等领域的全方位测序应用中推动科技进步。
HiFi 测序是长读长方法的金标准，即使是最复杂的基因组也能生成最完整、连续且正确的组装。我们先进的 Iso-Seq 方法为批量和单细胞 RNA 测序应用带来了清晰且精确的 HiFi 数据，帮助癌症研究人员捕获全长异构体，以前所未有的方式了解复杂的细胞过程。
2022 年度赢取项目赞助的癌症研究者
我们很荣幸地向大家介绍 2022 年 SMRT Grant癌症转录组学项目赞助的获得者，我们同样感到兴奋是看到他们希望通过更好地了解癌症生物学促进人类健康的潜力。
今年的 SMRT Grant癌症转录组学项目赞助收到了很多申请和一系列创新有前景的想法。我们从世界各地选出了三位杰出的获得者，他们的潜在影响力跨越了一系列研究领域，包括计算转录组学和骨髓增生异常。以下是 2022 年获胜的癌症研究提案：
Andre Darah Sim 博士
博士后研究助理
新加坡基因组研究所
将 Bambu 的转录本发现扩展到 PacBio 数据
已知癌细胞会经历转录组重组，导致几种异常的和新颖的转录本表达。转录本发现是理解癌细胞生理学的关键，然而，为长读长技术开发的大多数转录本发现工具并不能区分多种测序技术。Bambu 就是这样一种工具，它虽然在转录本发现方面表现亮眼，但使用的是与技术无关的模型。此举实现了 Bambu 的通用性，但也使它无法利用 PacBio 高度准确的碱基识别功能。我们建议用 PacBio 模块扩展 Bambu。这样不仅可通过定制的 PacBio 模块改善 Bambu 的功能，还将帮助 PacBio 数据在了解癌症进展的转录状态方面处于领先地位。
Anna S. Nam 医学博士
病理学助理教授
Weill Cornell 医学院
I 型干扰素诱导的 ADAR1 编辑对原发癌血细胞的影响
I 型干扰素 (IFN) 信号传导在肿瘤发生和免疫治疗中至关重要。在高度复杂的肿瘤微环境中存在其他细胞因子的情况下，研究人体肿瘤中体内分离的 IFN 信号传导十分具有挑战性。精确的长范围测序将使我们能够识别 A-to-I 编辑（使用未处理细胞的种系片段）和随之而来的异构体变化。这些发现可能会识别新的转录本异构体和编辑，从而增强癌细胞的适应性。
Syed A Mian 博士
Bonnet 实验室研究员
Francis Crick 研究所
骨髓增生异常中的骨髓微环境细胞 RNA 错误剪接结构的识别
骨髓增生异常 (MDS) 与造血干细胞 (HSC) 剪接体基因中存在的体细胞突变密切相关。鉴于短读长测序的局限性，我们无法完全解释这些在生态位细胞中诱导的全局错误剪接异构体的变化。因此，我们希望使用长读长 RNA 测序 (Iso-Seq) 方法对共培养的 HSC 和生态位细胞（MSC 和内皮细胞）进行批量 RNA 测序。 这里生成的数据不仅可以作为未来与 MDS 相关项目的基石，还可以应用于微环境发挥重要作用的其他癌症。
这些杰出的研究计划展示了 HiFi 测序和 Iso-Seq 方法的长度和准确度对于解决癌症生物学中一些挑战性和有趣问题有着无数种方式。 如果有兴趣获取 基于HiFi 测序的更多解读，以便在研究项目中开辟新的研究途径，可以考虑申请一项 SMRT Grant计划。
让我们再次祝贺所有的获得者！
关于 SMRT Grant计划
想要为即将开展的项目申请免费测序？了解如何申请未来的 SMRT 项目赞助。
SMRT Grant计划为科研人员提供了每年为其研究项目获得免费 HiFi 测序服务的机会。
对生命科学的所有领域都提供资助。无论是在研究复杂的微生物群、复杂癌症、稀有和濒危物种，还是在研究人类基因组的盲区，您都可以得到一笔资助。
如需申请，只需选择一个与您的研究领域相关的公开资助项目，阅读说明，填写申请表，并简洁地告诉我们您的研究将如何从 HiFi 测序中受益。对申请进行评估后，PacBio 会联系获得者，与经批准的测序服务供应商协调，发放免费的耗材、文库制备、HiFi 测序和初始生物信息学分析。
