介绍... VEGA
首款桌面式HiFi测序系统–为您的实验室带来业界领先、异常精确的长读长测序技术。
高质量的HiFi 数据，价格合理
Vega的售价远低于Revio系统，每次运行可生成60 Gb长读长数据。为独立实验室提供一流的精准HiFi 读数以及完整的基因组、转录组和表观遗传学数据。
按您的方式测序
无需分批处理，无需等待。通过自有平台，能更有效地管理项目时间，从头到尾控制您的时间表。
无忧的工作流程
现在，使用 HiFi 测序比以往任何时候都更简单，因为 PacBio 具有通用 HiFi 工作流程 – 从样本提取到数据分析。结合简单直观的运行设置，Vega 系统可提供可靠一致的结果。
小而强大
创新的将 Revio 平台的技术缩小后集成在桌面式系统中–在更小的仪器占地面积内提供相同质量的 HiFi 数据。
与 HiFi 文库预处理工作流程和 SMRT Link 运行管理软件无缝集成。
在每次运行中均可在仪器上进行初级分析，包括 DeepConsensus、甲基化检测和可选的多重样本条码拆分。
Vega system features
按您的方式测序
每次运行只需一个 SMRT Cell，意味着无需等待，让您掌控数据、时间和预算。通过自有平台测序，您可以简化您的工作流程，更快地完成项目，并根据您的应用需求量身定制每次运行 — 所有这一切都通过一台专为您的实验室和实验而设计的仪器来实现。
持续的生产力： Vega 可让您为下一次运行预先准备耗材，让您领先一步并提高效率。
节省计算和存储成本
Vega 系统不仅能够检测碱基 — 每次运行还会使用深度学习算法测量 DNA 甲基化状态。仪器上的初级分析包括多重样本条码拆分和转换为标准 BAM 格式 — 因此您可以更快地获得有意义的见解。高效的数据表示以大约 0.5 位/碱基对序列、质量值和甲基化进行编码 — 测序文件比其他长读长测序小 20 倍。
| Technology | On instrument | Off instrument | Typical putput file format and size |
|---|---|---|---|
 Vega system |
|
|
hifi_reads.bam Vega: 30 GB |
 Other long-read technology |
|
|
Fast5/pod5 1,300 GB |
无忧且灵活的工作流程，让您可以立即上手
- 从样本提取到数据分析，跨 PacBio 长读长系统的通用 HiFi 工作流程。
- 轻松进行 Nanobind 核酸提取和 HiFi SMRTbell 文库准备，提供文库手动和自动工作流程选项。
- 30 多个 PacBio 兼容合作伙伴提供无缝集成的试剂盒和分析解决方案，以支持刚开始使用 HiFi 或扩展其当前功能的客户。
- 世界一流的服务和支持团队。有了我们专业支持团队在您身边，管理订单和获得帮助从未如此简单。
常见问题
Vega 现已上市，预计2025 年第一季度开始发货。
是的，有三个公开的Vega数据集。了解 Vega 的功能 – 现在就下载并探索这些数据集
[数据集链接]
如果您已经在进行 HiFi 测序，那么过渡到 Vega 系统是无缝的。您的工作流程几乎保持不变，测序耗材试剂盒只有轻微变化。只需遵循命名指南，您就可以开始测序了！
从 Nanobind 样品制备试剂盒到 HiFi plex 文库制备试剂盒和 Kinnex 应用试剂盒，您当前所使用的试剂盒与 Vega 完全兼容。此外，您信赖的 Revio HiFi 分析工具也与 Vega 完美兼容。期待同样的高性能、可靠性和信心。
HiFi测序使用样本中的“天然” DNA 生成长达数千个核苷酸的单个读数。这样可以保留重要的碱基修饰，因此每次运行都会自动进行甲基化检测。
相比之下，短读长测序使用的片段要短的多（50 到 300 个碱基）并且需要进行扩增，这可能会引入偏差并丢失碱基修饰信息。这使得短读长测序更难处理复杂区域，如重复区域或异构体重排。
与其他长读长测序方法相比，HiFi 测序以其准确性和简便性而脱颖而出。
1Prices may differ by region. Contact PacBio sales rep for pricing in your currency.
挑战极限，而非空间
系统规格
Vega 桌面式系统使用单张 SMRT Cell，每次运行可提供高达 60 Gb 的 HiFi 数据（包括甲基化检测信息）。内置计算单元提供准确的碱基检测、使用 DeepConsensus 生成 HiFi 读数、甲基化检测、条码拆分和 BAM 文件生成。
| Library | Run time 1 | Q30+ bases | HiFi yield2 per SMRT Cell | Methylation | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1-5 kb | 12 hours | 95% | 608 million reads | 5mC at CpG sites for native DNA | ||||
| 5-10 kb | 24 hours | 90% | 25-50 Gb | |||||
| 10-15 kb | 50-60 Gb | |||||||
| 15-20 kb | 50-60 Gb | |||||||
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1 Run time refers to the data collection step, which determines the time between processing SMRT Cells. |
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主要应用和样本通量
HiFi 测序能准确检测从 SNP 到结构变异的各种变异类型，即使是在基因组中具有挑战性的区域，也能以高精确度和高召回率将问题转化为答案。关键应用子集包括：
| Library | Sample | Expected coverage3 | Per Vega SMRT Cell |
Per year |
||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1-5 kb | Amplicon | 50X | > 1,000 | 200,000 | ||||
| 5-10 kb | Microbial genome | 30X | 384 | 75,000 | ||||
| 5-10 kb | PureTarget repeat expansion panel | 200X | 48 | 9,600 | ||||
| 15-20 kb | Transcriptome with Kinnex full-length RNA kit | 10M reads | 3 | 600 | ||||
| 15-20 kb | Human genome | 20X | 1 | 200 | ||||
| 15-20 kb | Human methylation profiling | 5X | 4 | 800 | ||||
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3Expected coverages are estimates. |
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仪器规格:
| 运行环境 | ||
| 温度 | 19–25°C (66–77°F) | |
| 湿度 | 20%–80% 相对湿度，无冷凝 | |
| 通风 | 4,250 BTU/hr (1,250 W) | |
| 尺寸 | ||
| W × D × H | 55.7 厘米（21.9 英寸） × 69.5 厘米（27.4 英寸）× 76.8 厘米（30.2 英寸） | |
| 重量 | 125.2 千克（276磅） | |
| 电功率 | ||
| 所需电源 | 100–120 VAC，50-60 Hz | |
| 计算 | ||
| 网络连接 | 1 GbE | |
| 输出文件格式 | hifi_reads.bam; ~30 GB each, up to 6 TB per year | |
