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动植物基因组学

测序技术可捕获生物多样性、促进农业发展和改进基因编辑工作流程

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动植物基因组学解决方案

面对气候变化和人口膨胀,高度准确的长读长测序技术使动植物科学家们能够获得其他技术无法提供的实用基因组见解。

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农业基因组学

加快育种计划并提高对害虫、疾病和气候变化挑战的抵御能力。

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生物多样性

探索种群、物种和生态系统的生物多样性,以构建更为详细的生物群落视图。

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动植物生物学

解决进化、发育、基因表达、转录调控等相关问题。

动植物基因组学实践

image of cows grazing in green grass field

只需要一次建库即可对遗传和表观遗传变异进行全基因组检测和定相

只需要一次建库即可对遗传和表观遗传变异进行全基因组检测和定相

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stock image of a field of pink flowers

构建单倍型分辨率的泛基因组数据库以优化生物标志物开发

借助第三代测序工具,研究人员能够更好地估算复杂特征……

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plant animal resource 01

Pacbio与Corteva Agriscience 开展农业合作

为植物,害虫和微生物开发高通量HiFi测序解决方案

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获取更多

本站的综合信息文库中收录了关于 动植物基因组学 相关的文献、报告、论文和视频,单击下方按钮立即探索更多内容。

获取更多资源

共建未来

适用于巨型植物的基因组:加利福尼亚红杉

加利福尼亚红杉(Sequoia sempervirens) 是世界上生长最快的针叶树之一,可以存活数百年。它曾遍布北半球,而如今原始的古老海岸红杉林只剩下 5%。探索高度准确的长读长测序如何成功地对体量庞大且高度复杂的加利福尼亚红杉基因组进行测序。

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使用 HIFI 测序进行动植物基因组学研究的优势

高精准度的基因组测序有助于从构成我们这个世界的生物体中发现基因组线索。复杂的基因组和转录组为保护作物和牲畜健康提供了途径,并且可在分子水平上更好地了解动植物生物学。

HiFi 测序支持动植物研究的优势包括:

  • 为所有类型的生物构建更加完整、准确且定相的参考基因组
  • 可靠地识别各种类型的变异,包括 SNP、结构变异、拷贝数变异、易位和均聚物重复
  • 通过 RNA 测序发现新的生物学,提供全长、定相转录本序列,分析异构体并捕获 5′ UTR
  • 用表观遗传序列信息揭示先前隐藏的调控机制

Advantages of hifi dot plot

https://www.nature.com/articles/s41477-021-01031-8
长读长测序技术应用能够通过准确、可行的基因组数据应对全球挑战。

推动动植物基因组学研究的应用

全基因组测序

组装单倍型分辨率、完整且准确的从头组装基因组,同时在面临具有挑战性的复杂序列(例如高倍体、高 GC 含量和高度重复序列)时检测甲基化。

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结构变异检出

解决各种规模的变异——从 SNP 和结构变异到拷贝数变异和易位。

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靶向测序

即使在难以检测的基因组区域也能准确检测和发现所有变异类型,推动基因分型研究、育种计划等。

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RNA 测序

利用全长转录组测序发现新的生物学。分析异构体并捕获 5′ UTR 中的变异,以获得构建准确基因组注释所需的数据。

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SMRT grants

PACBIO 的 SMRT Grant项目通过向受资助方提供免费的长读长测序资源以支持推进科学发现的杰出研究

PACBIO 2021 年的动植物 SMRT Grant项目要求申请人“聚焦遗传变异,共创美好未来”。有数百名申请人期望使用 HiFi 测序来获得单倍型分辨率的泛基因组,从而推断出特征、捕获结构变异并破译复杂特征。今年的资助获得者秉承着追求食品更安全、更美味的未来这一原则,成功赢得了今年的资助。

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长读长测序有助于解决广泛动植物科学中的生物学问题

突破多倍性和杂合性障碍

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昆虫生物学

制定疾病预防方法,改善病虫害防治。

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作物改良

改善作物健康,进行特征选择,提高育种效率。

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动物健康与育种

研究遗传、免疫学和驯化的模式。

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海洋生物多样性

探索生态系统以研究生物进化内容并应对气候变化的挑战。

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物种保护

考察濒危物种的基因组多样性,以促进辅助生殖、野生动物管理和可持续性。

动植物研究的工作流程

易于使用的高通量测序流程,以合理的成本获得所需的测序准确度

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样本制备

灵活的 DNA 起始量要求,低至 300 ng

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文库制备

可调整的多重分析选项,大幅提高通量

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SMRT 测序

一次运行一个 SMRT Cell 8M,或设置为多个连续运行,即可自动进行测序

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数据分析

使用 SMRT Link 软件或开源工具分析您的 HiFi 数据

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这是属于你的时刻

以较低的成本和较高的产量进行长读。短读数具有卓越的准确性。从相对完整的画面到更加精细的细节,你的探索时刻即将到来。

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