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肿瘤普遍表现出 RNA 失调。Iso-Seq 方法揭示了可变剪切事件和融合事件的全貌。
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结构变异(基因组差异≥ 50 个碱基对)是肿瘤的主要驱动因素之一。大多数结构变异太大,无法通过短读长 DNA 测序可靠地发现。
适用于所有变异类型的一流变异检出,包括单核苷酸变异 (SNV)、插入缺失和拷贝数变异 (CNV)。
AS 可控制哪些内含子从 mRNA 前体中去除,哪些外显子结合形成最终的信使 RNA (mRNA)¹。
肿瘤研究实践
文献
适用于乳腺癌的全方位长读长异构体分析平台
长读长 RNA 测序可识别乳腺癌中的新型生物标志物和药物靶标。
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揭示复杂的肿瘤基因扩增
乳腺癌结构变异的详细比对。
肿瘤的RNA异构体全景
了解 PacBio 高度准确的长读长 RNA 测序如何在与癌症有关的 RNA 异构体领域创造的实质性的革命,并在本网络研讨会中了解癌症生物学的分子机制。
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为抗肿瘤研究提供新见解
Meredith Ashby 指明 SMRT 测序在基因组和转录组层面上加深了对肿瘤的价值的理解。
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