发掘 HIFI 测序的潜力
Revio 系统成本更低，通量更高，操作简易，准确度极高，可直接用于甲基化检测。
HiFi read 通量增加 15 倍
Revio 系统采用每张拥有 2500 万个 ZMW 的高密度SMRT Cell 芯片，能够并行运行最多 4 张 SMRT CELL 芯片，24 小时运行时间，每天可获得 360 Gb 的 HiFi reads，相当于每年能对 1300 个人类全基因组进行测序。
成本低至1,000 美元的完整定相人类基因组
HiFi 测序能通过单次建库与测序运行，提供人类基因组上的小变异、结构变异、重复扩增、甲基化与单倍型定相情况。
所需耗材减少一半，大大简化操作体验
Revio 系统操作简单，得益于试剂板与样本板的整合，支持快速运行设置，测序进行过程中能对运行进行灵活排序，以及无需外部氮气供应。
机载 Google Health DeepConsensus
Revio 系统上的高级算法可以实现非常高的读取准确率，并在每次运行时实现甲基化检出。优化的文件格式通过质量值结合智能 read 排序减少了数据存储需求。
HIFI 测序技术大规模应用
您可以用 Revio 系统实现更高通量，支持大型研究并开发新应用。Revio 系统每年可生成 1,300 个基于HiFi的人类全基因组数据，是 Sequel IIe 系统的 15 倍。具体为：
| Revio 系统 | Sequel IIe 系统 | 提升倍数 | |
|---|---|---|---|
| 密度更高 | 2500 万 ZMW | 8 万 ZMW | 3× |
| 独立芯片操作台 | 4 | 1 | 4× |
| 运行时间更短 | 24 小时 | 30 小时 | 1.25× |
| 15× |
简化的耗材
Revio 系统用的耗材更少，优化后便于追踪且大大减少浪费，从而简化了 HiFi 测序体验。工作流程改进后，花不到一分钟时间就能将耗材加载到仪器上。
Revio 聚合酶试剂盒
聚合酶试剂盒包含多种经过优化的试剂，可将聚合酶结合到 24 SMRTbell 文库中，为测序做准备。
Revio SMRT Cell 托盘
一个托盘包含 4 张高密度 SMRT Cell 芯片，每张都有 2500 万个零模波导孔。
Revio 测序板
测序板提供的试剂可对最多 4 张 Revio SMRT Cell 芯片进行测序，并将 Sequel IIe 系统的测序板、样本板、混合板与 SMRT Cell 油等多个组分集于一体。
为您独家定制的工作流程
Revio 系统所用的耗材与软件灵活方便，能极大简化使用步骤，优化体验。无论是在基因组中心还是小型实验室，您都能体验到：
快速可靠的文库制备
针对 Revio 系统的文库构建支持使用 SMRTbell 制备试剂盒 3.0 进行人工或自动制备。
快速运行设置
测序板与运行设计通过一个 NFC 标签实现自动连接，仅用不到一分钟即可在仪器上完成运行设置。
高度适配您的实验安排
Revio 系统的工作平台独立于四个芯片操作台，因此系统每天加载耗材的时间可长达 20 小时，可确保充分利用各个芯片工作台。
强大的计算能力
Revio 系统内置多个强大的 NVIDIA GPU，提供的计算能力超出 Sequel IIe 系统 20 倍，通过仪器即可直接输出即时可用的准确数据。
HiFi read 生成
GPU 可为碱基检出与 HiFi read 生成缩短周转时间，直接以 BAM 格式输出 HiFi reads。
Google Health DeepConsensus
DeepConsensus 使用高级深度学习技术进一步提高了 HiFi 测序的准确度与产量。
甲基化检出
标准运行包括 DNA 甲基化状态，使用能处理聚合酶动力学的深度学习算法计算。
拆分
包括条形码拆分在内的所有基本处理步骤均在仪器上完成。
HIFI 级准确度与数据质量
Revio 系统能实现与Sequel IIe同等或更优质的读长、碱基质量与变异检出性能，使得 HiFi 测序更广为人知。
读长
HiFi reads 有数万个碱基对长，可解析大的变异，将其映射到基因组的难测区域。
Read 质量与碱基质量
Revio 系统准确度非常高，90% 的碱基 ≥Q30，read 准确率中位数 ≥Q30，能提供可靠的答案。
变异检出
Revio 系统的 HiFi 测序能对所有变异类型输出准确度高的结果，媲美 Sequel IIe 系统赢得 precisionFDA 评选的准确度。1
“…Revio 系统的高通量功能让我们能把 HiFi 技术应用到农业生物科技领域的大量应用中“
——Corteva Agriscience 生物技术与基因组学技术经理 Gina Zastrow-Hayes
REVIO 长读长测序方法对比
| PacBio Revio | SBS 测序 | 纳米孔测序 | |
| 读长 | 15-20 kb | 2×150 bp | 10-100 kb |
| Read 准确度 | 99.95% (Q33) | 99.92% (Q31) | 99.26% (Q21) |
| 运行时间 | 24 小时 | 44 小时 | 72 小时 |
| 数据产出 | 90 Gb | 2,400–3,000 Gb | 50–110 Gb |
| 变异检出——SNV |
✓ |
✓ |
✓ |
| 变异检出-插入/缺失 |
✓ |
✓ |
X |
| 变异检出——SV |
✓ |
X |
✓ |
| 5mC 甲基化 |
✓ |
X |
✓ |
| 定相 |
✓ |
X |
✓ |
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测序规格
|
HiFi 产出2, 6 |
||||||
| 文库 |
运行时间3 |
1 SMRT Cell | 4 SMRT Cells | 碱基质量 | 甲基化 | |
| 15–20 kb | 24 小时 | 90 Gb | 360 Gb | 90% Q30+ | CpG 位点上的 5mC | |
应用性能
HiFi reads 可满足有不同覆盖率、读长与准确率要求的多种应用。按照典型的产量与覆盖率要求，精选的常用应用性能如下：
| 通量 | ||||
| 应用 | 每个 Revio SMRT Cell |
每年4 |
覆盖率期望值5 |
|
| 人类基因组 | 1 | 1,300 | 30× | |
| 单细胞转录组 | 1 | 1,300 | 8,000万 reads | |
| 大基因 panel (20 Mb) | 12 | 15,600 | 90% 目标位点 ≥10× | |
仪器规格
| 运行环境 | ||
| 温度 | 19–25°C (66–77°F) | |
| 湿度 | 20%–80% 相对湿度，无冷凝 | |
| 通风 | 13,000 BTU/h (3,800 W) | |
| 尺寸 | ||
| W × D × H | 92.7 厘米（36.5 英寸） × 91.4 厘米（36.0 英寸）× 174.5 厘米（68.7 英寸） | |
| 重量 | 465 千克（1,025 磅） | |
| 占地面积 | 243 厘米（96.0 英寸）× 138.5 厘米（54.5 英寸） | |
| 电功率 | ||
| 所需电源 | 200–240 VAC，50-60 Hz，max 5 kVA/4.8kW/24A | |
| 计算 | ||
| 网络连接 | 1 GbE 或 10 GbE 铜, RJ45 金属连接头 | |
| 输出文件格式 | hifi_reads.bam，每个文件大小 ≈55 Gb，每年高达 72 TB | |
常见问题
- 显示数据针对用于 HG002/GM24385 的单 Revio SMRT Cell 芯片。
- 基于 HG002/GM24385 人类 DNA 的 HiFi 产出规格使用 Nanobind CBB 试剂盒提取，并用 SMRTbell 制备试剂盒 3.0 制备。
- 运行时间规格针对测序反应而言。
- 年通量基于 1,300 块 Revio SMRT Cell 芯片计算。
- 期望覆盖率与通量均为估计值。因文库质量与片段长度差异，覆盖率可能会有所不同。
- HiFi产量取决于于文库片段的大小。对于小于15 kb的文库，产量通常较低。
